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结核分枝杆菌测序组合产品

基于亚洲bet356体育在线官网自主研发的试剂、高通量测序平台以及分析软件,覆盖从样本到结果全流程,组合产品搭配DNBSEQ-G99ARS平台,12小时可完成PE150测序,独有的DNBSEQ™测序技术,为下游分析提供高质量的测序数据保障;靶向MTB耐药和鉴定区域进行快速、精准的测序;配套软件实现MTBC鉴定和分型,分枝杆菌鉴定,变异检测,耐药预测,进化溯源分析,自动生成报告;为MTB的变异监测和耐药研究提供强有力的工具支撑。


结核分枝杆菌测序组合产品

ATOPlex 结核分枝杆菌扩增测序组合产品

货号:
900-000608-00,900-000611-00
DNBSEQ-G99ARS,DNBSEQ-G99RS 基因测序仪
940-001601-00,940-001599-00
ATOPlex MTB 建库试剂盒套装(96 RXN,576 RXN)
940-001654-00
DNBSEQ 一步法DNB制备试剂盒 V4.0(4 RXN)
940-001269-00
DNBSEQ-G99RS 高通量测序试剂套装(G99 FCL PE150)
970-000397-00
MTB-Explorer软件(16人份)
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结核分枝杆菌 WGS 测序组合产品

货号:
900-000070-00
MGISP-100RS 自动化样本制备系统(标配)
900-000560-00
DNBSEQ-G99ARS 基因测序仪(高配)
940-000027-00
MGIEasy Fast酶切DNA文库制备试剂套装(96 RXN)
940-000029-00
MGIEasy Fast酶切DNA文库制备试剂套装(16 RXN)
1000026466
DNBSEQ 一步法 DNB制备试剂盒(OS_DB)(4 RXN)
940-000410-00
DNBSEQ-G99RS 高通量测序试剂套装(G99 FCL PE150)
970-000385-00
MTB-Explorer软件
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推荐方案

ATOPlex 结核分枝杆菌扩增测序方案
仅需单管内2步扩增即可实现靶区域扩增建库,全流程速度快,支持15种抗结核药物耐药预测、174种分枝杆菌鉴定。



结核分枝杆菌 WGS 测序方案
可对结核分枝杆菌单菌样本进行快速、准确测序和基因组组装、实现结核分枝杆菌的基因组组装、分型鉴定、耐药预测和进化溯源分析,为结核分枝杆菌感染的精准鉴定、监测预警、溯源分析和精准防控提供工具支撑。



产品特点


建库操作简便
建库操作简便

基于自主研发的ATOPlex多重PCR建库平台,仅需单管内2步扩增即可实现靶区域扩增建库。

全流程速度快
全流程速度快
搭配DNBSEQ-G99ARS测序仪,从核酸到报告全流程最快24 h完成;适配DNBSEQ-E25测序仪,从核酸到报告全流程最快30 h完成。
样本无需培养
样本无需培养

靶向测序的高灵敏度支持痰液、灌洗液等混合样本;无需培养。

软件分析功能全
软件分析功能全

-覆盖WHO发布的《结核耐药相关变异目录》1所收录的一、二级1,200余个变异位点;扩增区域大小达到25.9 Kb

-涵盖目录收录的15种一线、二线抗结核药物耐药信息;52个基因或基因片段的变异信息

-支持结核分枝杆菌复合群(MTBC)鉴定,spoligotype分型鉴定;174种分枝杆菌鉴定

-进化溯源分析

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性能参数

产品名称 ATOPlex 结核分枝杆菌扩增测序组合产品
结核分枝杆菌 WGS 测序组合产品
预期用途
MTBC鉴定和分型,分枝杆菌鉴定,变异检测,耐药预测,进化溯源分析
结核菌株鉴定,基因组组装,变异检测,耐药信息预测,进化溯源
适用样本类型
痰液、灌洗液、培养单菌等类型样本
结核分枝杆菌单菌
推荐样本投入量

培养单菌提取DNA≥1 ng;痰液、灌洗液样本提取1 ng~10 ng

DNA≥10ng
从核酸到报告的周期
DNBSEQ-G99:24样本 ~26h;DNBSEQ-E25:8样本 ~30h
20小时
推荐测序读长
PE150+10+10
PE150+10+10
推荐测序数据量

3 M Reads/样本

5M Reads



样本报告


软件功能模块


软件包含序列检测、突变与耐药、谱系分型等模块,对单次分析的所有样本生成汇总报告,同时为任一样本提供单样本报告,点击即可打开。


耐药报告示例


汇总报告展示所有样本对应的突变与耐药信息,分别展示突变数据统计结果,耐药相关突变,不确定显著性突变、耐药不相关突变的信息、覆盖和频率信息。




汇总变异数据




耐药相关突变





不确定显著性突变、耐药不相关突变




进化溯源和样本间SNP距离分析


汇总报告将为所有测序样本自动构建进化树(左)和SNP距离分析热图(右)。


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