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2021年12月15日，国际乳品联合会（IDF）正式发布《IDF公报No.513/2021 益生菌菌株水平鉴定指导文件》（Bulletin of the IDF No. 513/2021: Identification of Probiotics at the strain level - Guidance Document）。这是我国首次主导完成的国际乳品联合会指导文件，DNBSEQTM作为国产高通量测序平台入选指导文件，获得国际乳品联合会及国内外学术界和产业界认可。
我国益生菌的基础研发和产业化进入快速发展阶段，成为食品工业创新升级的重要推动力之一。益生菌的健康功效已形成科学界广泛共识，其功能性和安全性具有菌株水平特异性。益生菌精准鉴定是行业发展的关键核心技术，目前国内外法规标准对此均提出了相应要求，但缺乏系统性的技术指导文件。
《IDF公报No.513/2021 益生菌菌株水平鉴定指导文件》是我国首次主导完成的IDF指导文件，由中国食品发酵工业研究院副院长、IDF乳品微生物分析方法委员会（SCAMDM）主席姚粟教授团队牵头修订，项目组成员包括来自中国、法国、波兰、丹麦、新西兰、瑞士、比利时、德国、日本等成员国专家，同时得到来自IDF中国国家委员会、IDF各技术委员会和各国家委员会的积极参与，引起国内外学术界和产业界的高度关注。
指导文件对益生菌的核心特征、益生菌种水平和菌株水平鉴定方法、以及全基因组测序分析和多组学技术联合应用做出了相应说明，为行业建立精准鉴定技术体系和标准化检测方法、助力实现益生菌产品生产过程一致性控制、提升行业监管和商业保护提供强有力的技术支撑，对益生菌跨行业的科学应用与创新发展具有重大意义。
DNBSEQTM作为国产测序平台获认可
此前，DNBSEQTM测序平台已经在科研领域多次得到国际组织及权威杂志的认可。2021年9月，由生物分子资源设施协会（ARBF）主导的ABRF NGS II期研究成果发表于Nature Biotechnology。该研究将人类基因组家族、单独菌株和细菌的宏基因组混合物，在六款主流的测序平台进行测序，并将各平台数据进行全方位、系统性比较，分析各个测序平台的性能差异和测序质量，以提供真实全面的参考证据。文章结果表明：“在短读长测序平台中，DNBSEQTM测序平台提供的测序错误率最低、在SNV与INDEL的检出上，表现出不同短序列测序平台之间高度的一致性。”
关于DNBSEQTM测序技术
DNBSEQTM测序技术主要包括：DNA单链环化和DNB（DNA nanoball，DNB）制备、规则阵列芯片（Patterned Array）、DNB加载、cPAS（combinatorial Probe Anchor Synthesis 联合探针锚定聚合测序法）、双端测序技术，以及配合的流体和光学检测技术和碱基识别算法等。
DNBSEQTM测序技术与其他现有的测序技术相比，比较突出的特点是完美结合了DNB的低错误积累和规则阵列芯片的高信号密度，大幅提高检测的准确性。此外，DNBSEQTM测序平台的标签跳跃少，能有效降低“张冠李戴”的情况。
参考文献：
Foox, J., Tighe, S.W., Nicolet, C.M. et al. Performance assessment of DNA sequencing platforms in the ABRF Next-Generation Sequencing Study. Nat Biotechnol 39, 1129–1140 （2021）.
