时空转录组FF产品方案
时空试剂产品包含了Stereo-seq技术流程所需的主要时空试剂和时空芯片,其中时空芯片上载有具有空间坐标信息的捕获探针,与组织切片结合后通过探针原位抓取组织内的 mRNA 分子并进行 cDNA 合成。研究人员通过 DNBSEQ 测序和 STOmics 配套的可视化分析工具,可获取特定样本超高分辨率下的空间转录组信息。
了解更多
-->
时空组学技术Stereo-seq结合H&E染色技术可在同一张切片上获得组织形态与时空转录组信息。根据H&E染色图像表征的病理信息,研究人员选取与特定科学问题相关的区域,提取对应表达矩阵,利用华大时空分析软件实现H&E图像与转录组表达矩阵的自动配准并进行下游高级分析,探索潜在分子机制。Stereo-seq 兼容H&E染色的产品方案有助于更准确地利用组织分型及获取特定组织区域的基因表达信息,帮助研究者们更好地理解生命过程以及疾病发生和发展的分子机制,为疾病诊断、治疗、预后提供新思路。
时空蛋白转录组Stereo-CITE利用Stereo-seq芯片上装载的具有空间坐标信息的捕获探针,可在同一张组织切片上原位捕获组织中的mRNA分子和抗体衍生标签 (Antibody Derived Tag, ADT) ,并通过空间条形码(Coordinate lD, CID)还原回空间位置,生成基因和蛋白空间表达图谱。生信分析工具支持蛋白组和转录组联合分析,可获取全视场样本的转录组和多蛋白空间分布信息 ,助力研究人员精准量化组织异质性和相关生物学意义,获得更广的空间组学研究视角。