全基因组关联分析（Genome-wide association studies，GWAS）是一种性状定位研究方法，它利用特定群体中每个个体的全基因组的分子标记，基于标记与目标基因的连锁不平衡关系（linkage disequilibrium, LD），结合表型信息，通过关联分析，获得与表型性状关联的候选基因或基因组区域。GWAS可与群体遗传研究相结合，挖掘物种的环境适应性机制，或研究人工选择作用机制。